程远芬教授积极从事有重大意义的科研课题，编纂《清史稿艺文志拾遗索引》（中华书局）；参加整理张元济遗稿《百衲本二十四史校勘记》（商务印书馆。承担《三国志》、《宋书》、《南齐书》、《隋书》、《新唐书》五种）；点校《宝礼堂宋本书录》（商务印书馆）；与杜泽逊合著《山东著名藏书家》（山东文艺出版社）；编纂《四库存目标注索引》（上海古籍出版社出）；翻译《儒家者言》（齐鲁书社）；点校《钱大昕序跋、竹汀先生日记钞、十驾斋养新录》（上海古籍出版社）。参加国家清史纂修工程《清人著述总目》编纂工作（副主编）、《清史•艺文志》、《山东文献集成》、《十三经注疏汇校》等。独立承担山东省教育厅课题《南北朝著述考》（已结题）。

先后在《北京大学学报》、《中国典籍与文化》、《书目季刊》、《图书馆理论与实践》、《藏书家》、《澳门地区文献信息学刊》等刊物发表论文二十余篇。其中《续修四库全书总目提要举证》一文获山东省教育厅优秀科研成果二等奖。

程远芬教授热爱教育，喜爱学生。辛勤滋育，兰蕙芬芳。三尺讲坛上怡然自得，二米书架下陶醉其中。与亲朋师友，朝夕论道，教学相长。先后被评为 “教书育人”先进个人、“我最喜爱的教师”。